MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	GT	3	6	11	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017561	CCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017561	TGG	2	6	152	157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017561	ACG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017561	CGC	2	6	275	280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017561	GTT	2	6	302	307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017561	CCTGTT	2	12	338	349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017561	GCG	3	9	360	368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017561	GCT	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017561	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017561	TTC	2	6	420	425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017561	GTT	2	6	427	432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017561	CAG	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017561	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017561	GTT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017561	CTTTG	2	10	554	563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017561	TCT	2	6	592	597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017561	GGT	2	6	657	662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017561	CGT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017561	CAG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017561	CCT	2	6	6872	6877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017561	GCC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017561	TGG	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017561	ATG	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017561	CCA	2	6	7221	7226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017561	CCA	2	6	7230	7235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017561	CCA	2	6	7299	7304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017561	AT	3	6	7360	7365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017561	AGT	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017561	AGC	2	6	7518	7523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017561	AAT	2	6	7539	7544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017561	ATCA	2	8	7575	7582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017561	CGG	2	6	7688	7693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017561	TTG	2	6	7717	7722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017561	CGG	2	6	8077	8082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017561	TG	3	6	8088	8093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017561	T	6	6	9109	9114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017561	AGGC	2	8	9129	9136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017561	GC	3	6	9153	9158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017561	GCA	2	6	9197	9202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017561	GTG	2	6	9374	9379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017561	GCA	2	6	9426	9431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017561	GCAG	2	8	9434	9441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017561	ATG	2	6	9485	9490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017561	CGA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017561	CCA	2	6	9596	9601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017561	CCA	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017561	GTT	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017561	TC	3	6	9768	9773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017561	CACC	2	8	9951	9958	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017561	CGC	2	6	10026	10031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017561	C	6	6	10051	10056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_017561	GCG	2	6	10229	10234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017561	AGT	2	6	10235	10240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017561	AGT	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017561	TTGC	2	8	10320	10327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017561	CGGACG	2	12	10386	10397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017561	TGG	2	6	10448	10453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017561	GAAC	2	8	10457	10464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017561	C	6	6	10505	10510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_017561	ATG	2	6	10588	10593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017561	TGA	2	6	10700	10705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017561	GTT	2	6	10771	10776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017561	A	6	6	10800	10805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017561	CCA	2	6	10822	10827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017561	AGC	2	6	10846	10851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017561	AG	3	6	10900	10905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017561	ACTG	2	8	10961	10968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017561	TGG	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017561	GAT	2	6	11037	11042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017561	CT	3	6	11068	11073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017561	AG	3	6	11077	11082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017561	TCAT	2	8	11083	11090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017561	GAAT	2	8	11102	11109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017561	GAAT	2	8	11366	11373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017561	GGT	2	6	11428	11433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017561	GTT	2	6	11435	11440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017561	T	6	6	12863	12868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017561	CAA	2	6	12870	12875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017561	AGA	2	6	13154	13159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017561	ATC	2	6	13202	13207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017561	T	6	6	13281	13286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017561	CTT	2	6	13293	13298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017561	CGC	2	6	13400	13405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017561	CGT	2	6	13458	13463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017561	AGC	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017561	TTGCA	2	10	14078	14087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017561	ATCC	2	8	14545	14552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017561	GAA	2	6	14617	14622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017561	CTA	2	6	14645	14650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017561	GAAA	2	8	14651	14658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017561	ATC	2	6	14715	14720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017561	TCCT	2	8	14744	14751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017561	TCT	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017561	CCG	2	6	14818	14823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017561	AAC	2	6	14830	14835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017561	GGT	2	6	14849	14854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017561	CAG	2	6	14880	14885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017561	AAT	2	6	14911	14916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017561	T	6	6	15572	15577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017561	GCA	2	6	17102	17107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017561	GCA	2	6	17125	17130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017561	GCA	2	6	17169	17174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017561	GCA	2	6	17192	17197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017561	CTT	2	6	17276	17281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017561	TCTAA	2	10	17291	17300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017561	CCG	2	6	17390	17395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017561	TAA	2	6	17521	17526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017561	GCT	2	6	17625	17630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017561	TAG	2	6	17654	17659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017561	TAG	3	9	17663	17671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017561	ATT	4	12	17676	17687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017561	GGC	2	6	18475	18480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017561	ACC	2	6	18525	18530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017561	TTA	2	6	18544	18549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017561	GTT	2	6	18580	18585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017561	CCG	2	6	18656	18661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017561	T	6	6	18770	18775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017561	AAG	2	6	19455	19460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017561	TGT	2	6	20463	20468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017561	CATC	2	8	20535	20542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017561	TGA	2	6	20570	20575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017561	ACC	2	6	20594	20599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017561	GTGAA	2	10	20613	20622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017561	TTA	2	6	20628	20633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017561	T	7	7	20639	20645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017561	ATT	2	6	20661	20666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017561	TCA	2	6	20691	20696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017561	CTTT	2	8	20728	20735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017561	T	6	6	20745	20750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017561	CTT	3	9	20755	20763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017561	T	6	6	20762	20767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017561	CT	3	6	20977	20982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017561	TGT	2	6	20987	20992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017561	ATT	2	6	21029	21034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017561	AGT	2	6	21062	21067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017561	TGA	2	6	21073	21078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017561	ATTTT	2	10	21086	21095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017561	AATT	2	8	21117	21124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017561	TGT	2	6	21134	21139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017561	T	6	6	21183	21188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017561	T	6	6	21194	21199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017561	AGT	2	6	21237	21242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017561	TTG	2	6	21284	21289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017561	TTA	2	6	21937	21942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017561	GGA	2	6	23324	23329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017561	ATTAT	2	10	23330	23339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017561	TGG	2	6	25027	25032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017561	CCAT	2	8	25124	25131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017561	TGA	2	6	25513	25518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017561	T	6	6	25524	25529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017561	GT	3	6	25543	25548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017561	TTGT	2	8	25639	25646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017561	GTTGG	2	10	25762	25771	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017561	TGG	2	6	25791	25796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017561	GCC	2	6	25826	25831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_017561	TCATG	2	10	25842	25851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017561	GT	3	6	25971	25976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017561	CCA	2	6	26085	26090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_017561	TGG	2	6	26112	26117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.